Per afrontar i resoldre els problemes de la competència professional que sorgeixen en el desenvolupament de l'activitat dels biòlegs, el CBC s'ha d'estructurar en comissions representatives de tots els àmbits de treball dels biòlegs catalans. Aquestes comissions serveixen per recollir opinions i experiències com a fòrum de comunicació i intercanvi, plantejar inquietuds i suggeriments, vetllar i defensar els espais professionals davant d'altres col·lectius i institucions, i desenvolupar els temes tècnics de les diferents especialitats.
